Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms