Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms