Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancaQ9JL70 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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FancaQ9JL70 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FancaQ9JL70 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FancaQ9JL70 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FancaQ9JL70 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FancaQ9JL70 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms