Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms