Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Uchl3Q9JKB1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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