Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gpa33Q9JKA5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpa33Q9JKA5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms