Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msgn1Q9JK54 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms