Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cog8Q9JJA2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog8Q9JJA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms