Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms