Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmbr1Q9JIT0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms