Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms