Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms