Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn19Q9ET38 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn19Q9ET38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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