Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms