Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Erg28Q9ERY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms