Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r171Q9EPS6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r171Q9EPS6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r171Q9EPS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r171Q9EPS6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r171Q9EPS6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r171Q9EPS6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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