Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pak1ip1Q9DCE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms