Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms