Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms