Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph3bQ9DA80 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms