Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms