Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd12Q9D8W5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms