Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SlirpQ9D8T7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms