Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms