Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms