Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn23Q9D7D7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms