Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf13Q9D777 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms