Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbe1Q9D6Y9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms