Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MsraQ9D6Y7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms