Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm5Q9D6G9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms