Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms