Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms