Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc83Q9D4V3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms