Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms