Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms