Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrp2bpQ9D4C6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp2bpQ9D4C6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms