Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1Q9D495 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms