Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus10Q9D3U0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus10Q9D3U0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms