Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stag1Q9D3E6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stag1Q9D3E6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms