Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef12Q9D2F1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms