Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms