Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1lQ9D1E5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms