Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms