Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms