Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx56Q9D0R4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx56Q9D0R4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx56Q9D0R4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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