Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc47Q9D024 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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