Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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