Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms