Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bud23Q9CY21 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bud23Q9CY21 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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