Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms